Clipboardは単純じゃないかもの後、やはり Clipboard Manager ソフトは常駐させたいので、他にフリーソフトがないか探してみました。
結果、Clipboard History(※1)がみつかりました。ソフトの詳細は他の多くのサイトに任せるとして、Windows7 はメモリーが 4GB に制限されているので以前に比べメモリー容量が増えるのは不満ですが、その分機能は豊富でなんと言っても AutoHotkey との干渉がないのがメリット。これから使っていこうと思っています。
クリップボードを介してのコピー・ペーストを頻繁にお使いの方は、何らかの Clipboard Manager ソフトをお使いかと思いますが、選択肢の一つとしてお試しください。
(※1) http://forest.watch.impress.co.jp/library/software/cliphist/